Durante el gobierno del Dr. Aldo Tessio y por iniciativa del Ministerio de Agricultura y Ganadería de la provincia de Santa Fe, propietario del inmueble de la ex – estancia perteneciente a la Familia Sa Pereira, fundadora de la localidad mediante Decreto Nº 01111 de fecha 16 de febrero de 1966 se crea en dichos terrenos la Escuela Agrotécnica “Cantón de Zárate”.
En el año 1972 la misma pasa a depender del Ministerio de Educación y Cultura provincial continuando con el mandato fundacional de Escuela con orientación granjera.
De esta manera se cumplimentó con una necesidad básica y primordial en cuanto a la situación geopolítica y ubicación rural permitiendo conformar un polo de atracción educacional en la región central de la provincia con proyección nacional.
El establecimiento inicia sus actividades educativas el día 26 de mayo de 1966, inaugurándose oficialmente el 24 de junio de ese mismo año.
Los objetivos son, desde siempre, la formación de técnicos de nivel medio orientados en el quehacer agropecuario en sus distintas especialidades, proporcionándoles conocimientos y destrezas agrotécnicas para desempeñarse en actividades productivas propias de una explotación agropecuaria e industrias del sector, brindando formación general que permita la prosecución de estudios terciarios o universitarios.
Los planes de estudio implementados fueron variando a través del tiempo, en sus comienzos se aplicó un plan nacional que fue reemplazado por uno provincial(Decreto Prov. 848/ 85) que comprendía un Ciclo Básico y uno Superior. Al completar el 3º año se extendía un certificado de Ciclo Básico Agrotécnico y al aprobar 5º año el título de Bachiller Agrotécnico.
Por disposición de las autoridades superiores del Ministerio de Cultura y Educación de la Nación conjuntamente con la jurisdicción provincial a fines de los años 80, se Enmarcó en el Programa Nacional EMETA (Expansión y Mejoramiento de Escuelas Técnico-Agropecuarias) considerándolo de gran envergadura, ya que permitió la expansión y mejoramiento de la Educación Técnica Agropecuaria. En la institución fue muy valioso el aporte de este programa, no sólo por el equipamiento brindado, sino también porque se instauró una concepción educativa nueva que favoreció la transformación educativa y la inserción de la escuela en el sector agropecuario local y regional.
La aprobación de la Ley Federal de Educación 24.195 en el año 1995 continúo con el camino de transformación del sistema de enseñanza – aprendizaje que requirió de la capacitación permanente de los protagonistas de este proceso de cambio y actualización y que se manifestó en el proyecto educativo.
La escuela debía adaptarse a los cambios socio-económicos-culturales para responder a las demandas sociales de la región formando un técnico polivalente, con capacidad de autogestión y comprometido con la realidad. Por ello, a partir de 1999 en la institución se puso en marcha la transformación educativa, siendo seleccionada por las autoridades nacionales y provinciales de educación como “Centro de Referencia para la implementación anticipada de la Educación Polimodal y el Trayecto Técnico Profesional” y así transferir la experiencia al resto del universo educativo de este nivel.
Desde el año 2012, se aplica el nuevo plan de estudios, por medio de la Resolución Provincial 69/11 que se encuadra en la Ley de Educación Nacional, la Ley de Educación Técnica de la Nación y las resoluciones del Consejo Federal de Educación.